Adabiyotlar almashinuvi: G'arbiy Afrikadagi yovvoyi mayda sutemizuvchilarning viruslarini profillash yangi viruslar va zoonotik xavflarni ochib beradi

Yaqinda nashr etilgan tadqiqotMikrobiomG'arbiy Afrikaning Syerra-Leone shahrida to'plangan 846 ta yovvoyi mayda sutemizuvchilar - jumladan, ko'rshapalaklar, kemiruvchilar va chigirtkalar - ustida virusli metagenomik tahlil o'tkazdi. Tadqiqotda jami 39 ta sutemizuvchilar bilan bog'liq RNK viruslari aniqlandi, ular orasida 26 ta yangi va 13 ta ilgari ma'lum bo'lgan viruslar mavjud. Ular orasida Paramyxoviridae oilasi eng yuqori xilma-xillikni namoyish etdi, kemiruvchilar esa eng ko'p virusli turlarga ega edi (n = 26).

Zoonotik xavfni baholash uchta ma'lum zoonotik virusni — ensefalomiyokardit virusi, Lassa virusi va Rocahepevirus sp. — shuningdek, potentsial tarqalish xavfi bo'lgan uchta virusni aniqladi: Melian virusi, kemiruvchilar gepatit virusi va Hunnivirus A. Shunisi e'tiborga loyiqki, yangi aniqlangan viruslar orasida Bat ledantevirus 2 odamga yuqtiruvchi Le Dantec virusi bilan eng yaqin filogenetik aloqani ko'rsatdi. Serologik tahlil mahalliy aholining 2,8 foizida ushbu virusga qarshi neytrallashtiruvchi antikorlarni aniqladi, bu esa ilgari odamlarga ta'sir qilish ehtimoli aniqlanmaganligini ko'rsatadi.

Ushbu topilmalar G'arbiy Afrikada kemiruvchilar ustunlik qiladigan virusli rezervuar mavjudligini ta'kidlaydi va odam-hayvonlar o'rtasidagi chegarada integratsiyalashgan kuzatuv strategiyalarining muhimligini ta'kidlaydi. Metagenomik skriningni serologik validatsiya bilan birlashtirish zoonotik va tarqalish potentsialiga ega viruslarni aniqlash uchun mustahkam asos yaratadi.
yangi viruslar va zoonotik xavflarni ochib beradi

So'nggi o'n yillikda odamlarda paydo bo'ladigan yuqumli kasalliklarning 60% dan ortig'i hayvonlar suv havzalaridan kelib chiqqan bo'lib, ko'rshapalaklar, kemiruvchilar va chigirtkalar zoonotik viruslarning asosiy mezbonlari sifatida tan olingan. Afrika keng tarqalgan zoonotik kasalliklarning eng ko'p tarqalgan nuqtasi hisoblanadi. Masalan, Syerra-Leoneda 2014-2016 yillarda Ebola epidemiyasi paytida 28 000 dan ortiq holat qayd etilgan.

Ushbu mintaqada zoonotik kasalliklarning katta yukiga qaramay, yovvoyi mayda sutemizuvchilarda viruslarning xilma-xilligi va tarqalishi yetarlicha tavsiflanmagan. Ushbu kamchilikni bartaraf etish uchun tadqiqotchilar 2018 va 2023 yillar oralig'ida Syerra-Leonedagi uchta joyda ushlangan 846 ta yovvoyi mayda sutemizuvchilarning virusom tahlilini o'tkazdilar. Tadqiqot viruslarning xilma-xilligini tavsiflash, turlararo yuqish potentsialiga ega nomzodlarni aniqlash, zoonotik xavfni baholash va yangi paydo bo'layotgan yuqumli kasalliklar haqida erta ogohlantirish tizimlarini qo'llab-quvvatlash uchun dalillar yaratishga qaratilgan edi.
Ketma-ketlik va yig'ish

Asosiy usullar

Tadqiqotda virusli metagenomikaning keng qamrovli ish jarayoni qo'llanildi:

  • Namunalarni qayta ishlash:Yurak, jigar, taloq, o'pka va buyrak to'qimalari to'plandi, birlashtirildi, gomogenizatsiya qilindi va to'liq RNK ekstraksiyasiga uchradi.
  • Ketma-ketlik va yig'ish:Kutubxona qurilishidan oldin ribosomali RNKning kamayishi amalga oshirildi, so'ngra Illumina NovaSeq 6000 platformasidan foydalangan holda yuqori o'tkazuvchanlikdagi ketma-ketlik yaratildi. Virusli kontiglar yangidan yig'ildi.
  • Virusni aniqlash:Viruslar RNKga bog'liq RNK polimeraza (RdRp) genining moslashuvi asosida aniqlandi. Bakterial, zamburug'li va o'simlik viruslari bundan mustasno, faqat umurtqali hayvonlar bilan bog'liq viruslar saqlanib qoldi.
  • Bioinformatika tahlili:Filogenetik rekonstruksiya, rekombinatsiya tahlili, turlararo uzatish tarmog'ini modellashtirish va zoonotik xavfni baholash o'tkazildi.
  • Serologik tasdiqlash:Bat ledantevirus 2 uchun VSV asosidagi psevdovirusni neytrallash tahlili ishlab chiqildi. Neytrallovchi antikorlar inson zardobining 2,8 foizida aniqlandi, bu esa zoonotik yuqish ehtimoli borligini ko'rsatadi.
    Serologik tasdiqlash

    O'qishNatijalar

    1. Viruslarni kashf etish va xilma-xillik

    Ushbu tadqiqotda Syerra-Leoneda to'plangan 846 ta yovvoyi hayvonlar, jumladan, kemiruvchilar, ko'rshapalaklar va chigirtkalar ustida transkriptomik ketma-ketlik tahlili o'tkazildi. To'liq RNKga bog'liq RNK polimeraza (RdRp) gen ketma-ketliklariga asoslanib, jami 39 ta sutemizuvchilar bilan bog'liq RNK viruslari aniqlandi, ular orasida ilgari ma'lum bo'lgan 13 ta virus va 26 ta yangi viruslar bor.

    Virus tarkibi jihatidan Paramyxoviridae oilasi uchta xoʻjayin turkumida eng yuqori darajadagi xilma-xillikni namoyish etdi, undan keyin Astroviridae va Picornaviridae. Xoʻjayinlarning tarqalishiga kelsak, kemiruvchilar eng katta virus xilma-xilligini taʼminladilar, jami 26 ta virus turini saqladilar, bu ularning mintaqada virus xilma-xilligi rezervuarlari sifatidagi muhim rolini koʻrsatadi.

    2. Zoonotik xavf

    Zoonotik xavfni baholash uchta ma'lum zoonotik virusni aniqladi: ensefalomiyokardit virusi, Lassa virusi va Rokahepevirus turlari. Bundan tashqari, uchta virus — Melian virusi, kemiruvchi gepatit virusi va Hunnivirus A — potentsial tarqalish xavfiga ega ekanligi aniqlandi.

    Yangi kashf etilgan 26 ta virus orasidan to'rttasi filogenetik va genom xususiyatlariga asoslanib yuqori zoonotik potentsialga ega deb taxmin qilingan. Shunisi e'tiborga loyiqki, Bat ledantevirus 2 ma'lum bo'lgan odamga yuqtirgan Le Dantec virusiga eng yaqin filogenetik aloqani ko'rsatdi.

    Keyingi serologik tekshiruvlar bu topilmani yanada tasdiqladi, chunki mahalliy aholining zardoblarining 2,8 foizida Bat ledantevirus 2 ga qarshi neytrallashtiruvchi antikorlar aniqlandi. Bu natija aniqlanmagan yoki asemptomatik infeksiyalar inson populyatsiyasida allaqachon sodir bo'lgan bo'lishi mumkinligini ko'rsatadi, bu esa zoonotik yuqish yo'lining potentsial, ammo ilgari aniqlanmaganligini ko'rsatadi.

    3. Turlararo uzatish dinamikasi

    Turlararo yuqish tahlili shuni ko'rsatdiki, kemiruvchilar virus almashish tarmog'ida markaziy o'rinni egallaydi va mezbon turlar o'rtasida virus almashinuvini osonlashtiradigan asosiy tugunlar vazifasini bajaradi. Turlararo yuqish potentsialiga ega bo'lgan jami 15 ta virus aniqlandi.

    O'zaro tartibli uzatish naqshlarining keyingi tahlili shuni ko'rsatdiki, virus almashinuvi bir xil taksonomik tartibdagi xostlar o'rtasida tez-tez sodir bo'ladi, bu esa xost bilan bog'liqlik uzatish dinamikasida muhim rol o'ynashini ko'rsatadi. Aksincha, ko'rshapalaklar o'zaro tartibli uzatish uchun nisbatan pastroq imkoniyatga ega edilar.

    Muhimi, ayrim viruslarda xoʻjayinlarning tarqalish doirasining kengayishi kuzatildi. Masalan, ilgari shrewlarga xos deb hisoblangan Melian virusi ushbu tadqiqotda kemiruvchilarda ham aniqlandi, bu xoʻjayinning moslashuvchanligidagi oʻzgarish va kengroq yuqish xavfining ortishini koʻrsatadi.

    Turlararo uzatish dinamikasi

    Xulosalar va sog'liqni saqlashga ta'siri

    • Yovvoyi mayda sutemizuvchilarda viruslarning yuqori xilma-xilligi:26 ta yangi turni o'z ichiga olgan 39 ta RNK virusining kashf etilishi mintaqada katta virus rezervuarini ochib beradi va birinchi marta yuqori zoonotik salohiyatga ega yangi viruslar (masalan, Bat ledantevirus 2) haqida xabar beradi.
    • Kemiruvchilar ustuvor kuzatuv maqsadlari sifatida:Kemiruvchilar virus yuqishining asosiy markazlari bo'lib xizmat qiladi va eng yuqori virus xilma-xilligiga ega bo'lib, bu eng katta tarqalish xavfini anglatadi.
    • Integratsiyalashgan kuzatuv strategiyalariga ehtiyoj:Ushbu topilmalar faol kuzatuv dasturlarida kemiruvchilarga ustuvorlik berishni va inson va yovvoyi tabiat chegaralarida metagenomika, serologiya va ekologik monitoringni birlashtirgan integratsiyalashgan yondashuvlarni joriy etishni qo'llab-quvvatlaydi.

    Umuman olganda, ushbu tadqiqot paydo bo'layotgan zoonotik kasalliklar uchun erta ogohlantirish tizimlari va xavfni baholash tizimlarini qo'llab-quvvatlash uchun muhim dalillarni taqdim etadi va yuqori xavfli hududlarda proaktiv kuzatuvning ahamiyatini kuchaytiradi.

    Mahsulot haqida ma'lumot

    Mahsulot haqida ma'lumot1


Nashr vaqti: 2026-yil 23-mart